Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Snrpd3P62320 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms