Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga11P61622 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms