Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arl1P61211 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms