Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Siah1aP61092 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms