Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ActbP60710 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ActbP60710 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ActbP60710 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms