Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms