Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms