Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpaP58389 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpaP58389 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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PtpaP58389 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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PtpaP58389 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PtpaP58389 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpaP58389 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms