Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samsn1P57725 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms