Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtskP55097 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtskP55097 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtskP55097 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtskP55097 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtskP55097 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtskP55097 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtskP55097 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtskP55097 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtskP55097 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms