Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrlP54846 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrlP54846 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrlP54846 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NrlP54846 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms