Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ptpn5P54830 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms