Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CnbpP53996 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CnbpP53996 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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