Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PctpP53808 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PctpP53808 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PctpP53808 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PctpP53808 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PctpP53808 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms