Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CcnfP51944 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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