Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CntfP51642 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CntfP51642 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CntfP51642 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CntfP51642 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CntfP51642 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms