Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hcls1P49710 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hcls1P49710 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms