Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CitP49025 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CitP49025 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CitP49025 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CitP49025 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms