Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gbx2P48031 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms