Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TgfaP48030 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TgfaP48030 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TgfaP48030 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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