Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Resp18P47939 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Resp18P47939 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms