Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrprbP47758 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrprbP47758 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrprbP47758 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms