Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ly6dP35459 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ly6dP35459 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms