Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch4P31695 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms