Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RxrbP28704 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RxrbP28704 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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