Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atxn10P28658 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms