Protein–RNA interactions for Protein: P28311

Defa4, Alpha-defensin 4, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa4P28311 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa4P28311 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa4P28311 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa4P28311 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa4P28311 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms