Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gjc1P28229 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms