Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Xrcc5P27641 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Xrcc5P27641 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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