Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctnna1P26231 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna1P26231 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms