Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk11bP24788 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk11bP24788 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms