Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znf239P24399 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms