Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnnc2P20801 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnnc2P20801 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms