Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ms4a2P20490 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms