Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PrkcaP20444 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms