Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VimP20152 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VimP20152 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VimP20152 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms