Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PdgfaP20033 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PdgfaP20033 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PdgfaP20033 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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