Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc1P18828 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms