Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18526 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18526 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
P18526 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P18526 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P18526 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P18526 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms