Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spi1P17433 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Spi1P17433 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms