Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Msx1P13297 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Msx1P13297 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Msx1P13297 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Msx1P13297 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Msx1P13297 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Msx1P13297 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Msx1P13297 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Msx1P13297 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx1P13297 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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