Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Defa1P11477 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms