Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sbk3P0C5K0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sbk3P0C5K0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms