Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PtprqP0C5E4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PtprqP0C5E4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PtprqP0C5E4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PtprqP0C5E4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprqP0C5E4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprqP0C5E4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprqP0C5E4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprqP0C5E4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprqP0C5E4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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