Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa4P06798 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms