Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tk1P04184 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tk1P04184 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tk1P04184 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms