Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01878 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01878 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01878 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01878 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01878 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms