Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ComtO88587 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ComtO88587 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ComtO88587 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ComtO88587 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ComtO88587 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ComtO88587 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms