Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Dnmt3bO88509 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Dnmt3bO88509 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnmt3bO88509 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Dnmt3bO88509 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Dnmt3bO88509 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Dnmt3bO88509 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Dnmt3bO88509 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Dnmt3bO88509 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnmt3bO88509 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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