Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dsg2O55111 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms